Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TOP3AQ13472 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TOP3AQ13472 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TOP3AQ13472 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TOP3AQ13472 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TOP3AQ13472 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TOP3AQ13472 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TOP3AQ13472 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TOP3AQ13472 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TOP3AQ13472 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TOP3AQ13472 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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TOP3AQ13472 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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TOP3AQ13472 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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TOP3AQ13472 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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TOP3AQ13472 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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TOP3AQ13472 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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TOP3AQ13472 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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TOP3AQ13472 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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TOP3AQ13472 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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TOP3AQ13472 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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TOP3AQ13472 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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