Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATMQ13315 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATMQ13315 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATMQ13315 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATMQ13315 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATMQ13315 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATMQ13315 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATMQ13315 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATMQ13315 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATMQ13315 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATMQ13315 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATMQ13315 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATMQ13315 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATMQ13315 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATMQ13315 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATMQ13315 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATMQ13315 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATMQ13315 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATMQ13315 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATMQ13315 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATMQ13315 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATMQ13315 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATMQ13315 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATMQ13315 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATMQ13315 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATMQ13315 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATMQ13315 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATMQ13315 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATMQ13315 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATMQ13315 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATMQ13315 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATMQ13315 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATMQ13315 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATMQ13315 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATMQ13315 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATMQ13315 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATMQ13315 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATMQ13315 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATMQ13315 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATMQ13315 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATMQ13315 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATMQ13315 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATMQ13315 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATMQ13315 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATMQ13315 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATMQ13315 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATMQ13315 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATMQ13315 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATMQ13315 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATMQ13315 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATMQ13315 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATMQ13315 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATMQ13315 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATMQ13315 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATMQ13315 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATMQ13315 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATMQ13315 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATMQ13315 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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