Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.063e-7■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.023e-7■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 CORO1B-204ENST00000537042 1954 ntTSL 521.25■□□□□ 0.993e-7■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 CORO1B-209ENST00000616321 4464 ntTSL 214.48□□□□□ -0.093e-7■■■□□ 14.7
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PABPC4Q13310 ARHGDIA-209ENST00000582309 628 ntTSL 220.58■□□□□ 0.892e-7■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 ARHGDIA-206ENST00000580033 547 ntTSL 420.41■□□□□ 0.862e-7■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.372e-7■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.252e-7■■■□□ 14.7
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PABPC4Q13310 RAB11A-206ENST00000567671 635 ntTSL 38.61□□□□□ -1.032e-7■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 TAF1D-214ENST00000530089 1429 ntTSL 37.36□□□□□ -1.232e-7■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 MGEA5-211ENST00000494347 712 ntTSL 27.06□□□□□ -1.282e-7■■■□□ 14.7
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PABPC4Q13310 MGEA5-209ENST00000482611 1664 ntTSL 1 (best)6.76□□□□□ -1.332e-7■■■□□ 14.7
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PABPC4Q13310 TAF1D-212ENST00000529794 1123 ntTSL 26.61□□□□□ -1.352e-7■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.432e-7■■■□□ 14.7
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PABPC4Q13310 XPO7-209ENST00000522015 444 ntTSL 35.68□□□□□ -1.52e-7■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 TAF1D-221ENST00000540232 483 ntTSL 35.46□□□□□ -1.542e-7■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.622e-7■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.652e-7■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 BCLAF1-219ENST00000534269 4239 ntTSL 1 (best)4.59□□□□□ -1.672e-7■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 MGEA5-206ENST00000461645 743 ntTSL 24.2□□□□□ -1.742e-7■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.772e-7■■■□□ 14.7
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PABPC4Q13310 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.882e-7■■■□□ 14.7
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PABPC4Q13310 MIER1-203ENST00000357692 4978 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.292e-6■■■□□ 14.7
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PABPC4Q13310 PRDX6-201ENST00000340385 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.116e-11■■■□□ 14.7
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PABPC4Q13310 TANGO2-206ENST00000411907 568 ntTSL 426.48■■□□□ 1.835e-11■■■□□ 14.7
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PABPC4Q13310 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.665e-11■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.365e-11■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 TANGO2-213ENST00000444651 847 ntTSL 316.86■□□□□ 0.295e-11■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 TANGO2-224ENST00000485715 617 ntTSL 516.29■□□□□ 0.25e-11■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.185e-11■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.135e-11■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.025e-11■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.045e-11■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.115e-11■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 ADAM17-201ENST00000310823 4349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.55e-11■■■□□ 14.7
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PABPC4Q13310 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.032e-6■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 PPOX-213ENST00000497522 816 ntTSL 419■□□□□ 0.632e-6■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.62e-6■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.342e-6■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.242e-6■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 PPOX-215ENST00000537523 734 ntTSL 312.84□□□□□ -0.352e-6■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.662e-6■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.512e-6■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.462e-6■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.322e-6■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.465e-36■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 POLD1-209ENST00000597963 737 ntTSL 219.81■□□□□ 0.769e-7■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.373e-7■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.184e-8■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 JPT2-206ENST00000562684 3185 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.181e-6■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 JPT2-201ENST00000248098 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.251e-6■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 JPT2-205ENST00000562569 458 ntTSL 38.39□□□□□ -1.071e-6■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 PSMB3-211ENST00000619426 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.133e-15■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 PSMB3-208ENST00000613870 662 ntTSL 39.64□□□□□ -0.873e-15■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 PSMB3-212ENST00000620309 552 ntTSL 28.36□□□□□ -1.073e-15■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.589e-8■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.589e-8■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 NOP53-210ENST00000599582 626 ntTSL 316.01■□□□□ 0.151e-8■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 TNNT1-213ENST00000589226 604 ntTSL 216.22■□□□□ 0.198e-8■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 SLC25A39-215ENST00000592372 867 ntTSL 320.05■□□□□ 0.88e-7■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 SLC25A39-217ENST00000593166 797 ntTSL 318.36■□□□□ 0.538e-7■■■□□ 14.7
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