Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 SEM1-207ENST00000466986 507 ntTSL 27.38□□□□□ -1.238e-6■□□□□ 8.2
TARDBPQ13148 SEM1-219ENST00000618105 544 ntTSL 26.09□□□□□ -1.438e-6■□□□□ 8.2
TARDBPQ13148 SEM1-217ENST00000617133 591 ntTSL 26.04□□□□□ -1.448e-6■□□□□ 8.2
TARDBPQ13148 SEM1-220ENST00000619259 462 ntTSL 25.24□□□□□ -1.578e-6■□□□□ 8.2
TARDBPQ13148 LDHB-209ENST00000542765 672 ntTSL 24.56□□□□□ -1.682e-21■□□□□ 8.2
TARDBPQ13148 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.365e-7■□□□□ 8.1
TARDBPQ13148 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.135e-7■□□□□ 8.1
TARDBPQ13148 CTSL-206ENST00000495822 988 ntTSL 1 (best)15.13■□□□□ 0.015e-7■□□□□ 8.1
TARDBPQ13148 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.045e-7■□□□□ 8.1
TARDBPQ13148 CTSL-204ENST00000375894 975 ntTSL 314.17□□□□□ -0.145e-7■□□□□ 8.1
TARDBPQ13148 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.185e-7■□□□□ 8.1
TARDBPQ13148 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.275e-7■□□□□ 8.1
TARDBPQ13148 CTSL-205ENST00000482054 908 ntTSL 213.34□□□□□ -0.275e-7■□□□□ 8.1
TARDBPQ13148 HSP90B1-203ENST00000548462 3032 ntTSL 210.95□□□□□ -0.665e-7■□□□□ 8.1
TARDBPQ13148 HSP90B1-209ENST00000552051 581 ntTSL 29.01□□□□□ -0.975e-7■□□□□ 8.1
TARDBPQ13148 HSP90B1-207ENST00000550595 694 ntTSL 26.39□□□□□ -1.395e-7■□□□□ 8.1
TARDBPQ13148 URI1-204ENST00000570704 559 ntTSL 43.66□□□□□ -1.825e-7■□□□□ 8.1
TARDBPQ13148 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.333e-7■□□□□ 8
TARDBPQ13148 CDC73-202ENST00000477868 764 ntTSL 39.18□□□□□ -0.943e-7■□□□□ 8
TARDBPQ13148 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.263e-7■□□□□ 8
TARDBPQ13148 LSM14B-202ENST00000279069 811 ntTSL 327.56■■■□□ 22e-7■□□□□ 8
TARDBPQ13148 LSM14B-205ENST00000400318 1073 ntTSL 1 (best)26.57■■□□□ 1.842e-7■□□□□ 8
TARDBPQ13148 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.82e-7■□□□□ 8
TARDBPQ13148 LSM14B-203ENST00000361670 1239 ntTSL 523.18■■□□□ 1.32e-7■□□□□ 8
TARDBPQ13148 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.842e-7■□□□□ 8
TARDBPQ13148 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.472e-7■□□□□ 8
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