Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
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