Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRJQ12913 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.1 ms