Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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CNTN1Q12860 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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CNTN1Q12860 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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CNTN1Q12860 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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CNTN1Q12860 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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CNTN1Q12860 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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CNTN1Q12860 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
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