Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms