Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms