Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms