Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms