Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVPABLB-1P60509 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms