Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms