Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms