Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ME1P48163 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ME1P48163 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ME1P48163 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ME1P48163 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ME1P48163 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ME1P48163 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ME1P48163 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ME1P48163 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ME1P48163 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ME1P48163 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ME1P48163 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ME1P48163 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ME1P48163 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ME1P48163 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ME1P48163 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ME1P48163 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ME1P48163 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ME1P48163 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ME1P48163 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ME1P48163 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ME1P48163 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ME1P48163 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ME1P48163 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ME1P48163 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ME1P48163 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ME1P48163 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ME1P48163 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ME1P48163 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ME1P48163 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ME1P48163 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ME1P48163 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ME1P48163 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ME1P48163 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ME1P48163 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ME1P48163 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ME1P48163 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms