Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP5OP48047 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms