Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATRXP46100 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATRXP46100 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATRXP46100 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRXP46100 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRXP46100 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRXP46100 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRXP46100 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRXP46100 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms