Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms