Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNA7P36544 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms