Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP214P35658 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP214P35658 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP214P35658 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP214P35658 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP214P35658 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP214P35658 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP214P35658 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP214P35658 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP214P35658 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP214P35658 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP214P35658 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP214P35658 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP214P35658 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP214P35658 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP214P35658 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP214P35658 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP214P35658 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP214P35658 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP214P35658 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP214P35658 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP214P35658 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP214P35658 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP214P35658 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms