Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6P35125 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6P35125 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6P35125 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6P35125 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6P35125 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6P35125 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6P35125 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6P35125 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6P35125 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6P35125 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6P35125 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6P35125 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6P35125 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6P35125 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6P35125 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6P35125 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6P35125 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6P35125 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6P35125 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6P35125 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6P35125 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6P35125 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6P35125 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6P35125 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6P35125 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6P35125 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6P35125 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6P35125 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6P35125 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6P35125 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6P35125 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6P35125 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6P35125 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP6P35125 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP6P35125 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP6P35125 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP6P35125 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP6P35125 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP6P35125 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP6P35125 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP6P35125 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP6P35125 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP6P35125 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP6P35125 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6P35125 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
USP6P35125 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
USP6P35125 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
USP6P35125 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
USP6P35125 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6P35125 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6P35125 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6P35125 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6P35125 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6P35125 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6P35125 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6P35125 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6P35125 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6P35125 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6P35125 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6P35125 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6P35125 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms