Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AC084759.2-202ENST00000557976 1053 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AP001198.2-201ENST00000593121 466 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG3P32926 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 PQLC2L-206ENST00000468043 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AC137794.1-201ENST00000509185 914 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG3P32926 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms