Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBL1P28749 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBL1P28749 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBL1P28749 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBL1P28749 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBL1P28749 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBL1P28749 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBL1P28749 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBL1P28749 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBL1P28749 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBL1P28749 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RBL1P28749 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBL1P28749 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBL1P28749 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBL1P28749 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBL1P28749 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBL1P28749 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBL1P28749 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBL1P28749 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBL1P28749 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBL1P28749 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBL1P28749 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBL1P28749 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBL1P28749 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBL1P28749 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBL1P28749 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBL1P28749 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBL1P28749 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBL1P28749 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBL1P28749 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBL1P28749 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBL1P28749 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBL1P28749 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBL1P28749 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBL1P28749 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBL1P28749 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBL1P28749 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBL1P28749 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBL1P28749 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBL1P28749 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBL1P28749 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBL1P28749 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBL1P28749 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBL1P28749 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBL1P28749 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBL1P28749 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RBL1P28749 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBL1P28749 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBL1P28749 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBL1P28749 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBL1P28749 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBL1P28749 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBL1P28749 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBL1P28749 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBL1P28749 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBL1P28749 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBL1P28749 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBL1P28749 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms