Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF35P13682 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms