Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8BP10966 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8BP10966 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8BP10966 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8BP10966 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8BP10966 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8BP10966 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8BP10966 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8BP10966 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8BP10966 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8BP10966 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8BP10966 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8BP10966 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8BP10966 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8BP10966 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8BP10966 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8BP10966 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8BP10966 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8BP10966 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8BP10966 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8BP10966 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8BP10966 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8BP10966 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8BP10966 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8BP10966 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8BP10966 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8BP10966 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8BP10966 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8BP10966 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8BP10966 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8BP10966 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8BP10966 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD8BP10966 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms