Protein–RNA interactions for Protein: O60941

DTNB, Dystrobrevin beta, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTNBO60941 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DTNBO60941 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DTNBO60941 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DTNBO60941 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DTNBO60941 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DTNBO60941 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DTNBO60941 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DTNBO60941 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DTNBO60941 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DTNBO60941 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DTNBO60941 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DTNBO60941 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DTNBO60941 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DTNBO60941 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DTNBO60941 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DTNBO60941 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DTNBO60941 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DTNBO60941 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DTNBO60941 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DTNBO60941 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DTNBO60941 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DTNBO60941 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DTNBO60941 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DTNBO60941 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTNBO60941 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTNBO60941 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DTNBO60941 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DTNBO60941 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DTNBO60941 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DTNBO60941 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DTNBO60941 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DTNBO60941 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DTNBO60941 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DTNBO60941 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms