Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CALUO43852 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CALUO43852 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CALUO43852 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALUO43852 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALUO43852 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALUO43852 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALUO43852 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CALUO43852 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALUO43852 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALUO43852 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALUO43852 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALUO43852 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALUO43852 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALUO43852 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALUO43852 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALUO43852 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALUO43852 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALUO43852 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALUO43852 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALUO43852 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALUO43852 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALUO43852 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CALUO43852 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALUO43852 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALUO43852 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALUO43852 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALUO43852 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALUO43852 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALUO43852 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALUO43852 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALUO43852 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms