Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCO2O43819 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCO2O43819 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCO2O43819 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCO2O43819 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCO2O43819 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCO2O43819 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCO2O43819 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCO2O43819 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCO2O43819 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCO2O43819 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCO2O43819 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCO2O43819 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCO2O43819 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCO2O43819 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCO2O43819 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCO2O43819 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCO2O43819 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCO2O43819 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCO2O43819 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCO2O43819 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCO2O43819 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCO2O43819 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms