Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SIAH2O43255 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIAH2O43255 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SIAH2O43255 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms