Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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C4orf47A7E2U8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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C4orf47A7E2U8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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C4orf47A7E2U8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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C4orf47A7E2U8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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C4orf47A7E2U8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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C4orf47A7E2U8 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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C4orf47A7E2U8 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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C4orf47A7E2U8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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C4orf47A7E2U8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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C4orf47A7E2U8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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C4orf47A7E2U8 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C4orf47A7E2U8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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