Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD1BQ9UPS6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD1BQ9UPS6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms