Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
KDM5BQ9UGL1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms