Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms