Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms