Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVK-5Q9HDB9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms