Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NYXQ9GZU5 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms