Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDCA7Q9BWT1 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA7Q9BWT1 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms