Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
FYCO1Q9BQS8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FYCO1Q9BQS8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms