Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQB6

VKORC1, Vitamin K epoxide reductase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VKORC1Q9BQB6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VKORC1Q9BQB6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms