Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms