Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CMTM3Q96MX0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CMTM3Q96MX0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CMTM3Q96MX0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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