Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms