Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG2BQ96BY7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms