Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX33Q8WV41 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms