Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAAF3Q8N9W5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms