Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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RNF182Q8N6D2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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RNF182Q8N6D2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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RNF182Q8N6D2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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RNF182Q8N6D2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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RNF182Q8N6D2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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