Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TCF23Q7RTU1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TCF23Q7RTU1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TCF23Q7RTU1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TCF23Q7RTU1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TCF23Q7RTU1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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