Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SSH2Q76I76 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SSH2Q76I76 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms