Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRNP1Q6NT89 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms