Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP170Q5SW79 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms